La labor científica del Dr. Jaime Mora inició en 1960 en el Instituto Nacional de Nutrición con el estudio de las enzimas del ciclo de la urea en modelos animales. En los 70s, en el Instituto de Investigaciones Biomédicas-UNAM trabajó en las enzimas de la asimilación del nitrógeno, GS, GOGAT y GDH en el hongo Neurospora crassa. A partir de los 80s sus proyectos cambiaron a las bacterias rhizobia, que se asocian con leguminosas, estudiando los ciclos de asimilación de nitrógeno, carbono y fijación de nitrógeno.  En Rhizobium publicó los primeros trabajos de evolución genómica, además de reportar el aislamiento de rhizobia fijadoras de nitrógeno de la semilla de frijol. En el área aplicada, a partir de su proyecto de modificación de la regulación de la nitrogenasa, logró líneas mejoradas que formaron parte del primer biofertilizante para frijol en México. Actualmente trabaja en la importancia de las carboxilaciones en el metabolismo de Rhizobium, la participación de biotina, sensores de ácido aspártico y una nueva enzima RubisCO. Sus xxx trabajos de investiación han recibido xxx citas y ha participado en xxx congresos nacionales e internacionales.