Nació en la Ciudad de México en 1955, es Químico por la Universidad Iberoamericana y Doctor en Investigación Biomédica por la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM). Desde 1981, es investigador en el Instituto de Biotecnología de la UNAM, donde su participación fue crucial en la instalación y consolidación de la ingeniería genética y la biotecnología. El Dr. Soberón ha impulsado líneas de investigación innovadoras, destacando su trabajo en la síntesis química del ADN y sus aplicaciones en el desarrollo de biofármacos, vacunas, así como en la genómica microbiana y humana.

A lo largo de su carrera, ha realizado estancias de investigación en el City of Hope Medical Center de Los Ángeles y en las Universidades de California en San Francisco y San Diego. Ha publicado más de 100 trabajos de investigación en revistas internacionales, y ha dirigido más de 40 tesis de licenciatura y posgrado en los programas de Ciencias Biomédicas y Bioquímicas de la UNAM. Además, fue uno de los fundadores de la Licenciatura en Ciencias Genómicas de la UNAM.

Su labor científica ha sido reconocida con múltiples distinciones, incluyendo el Premio Nacional de Química en 1999, el reconocimiento como Investigador Nacional Emérito en 2024 y como Investigador en Ciencias Médicas categoría F por la Secretaría de Salud. Es miembro de las Academias Mexicana de Ciencias y Nacional de Medicina.

En 2017, fue nombrado miembro de la Junta de Gobierno del Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias “Ismael Cosío Villegas”. También fue miembro de la Junta de Gobierno de la UNAM (2013-2020).

El Dr. Soberón ha combinado su investigación con una intensa labor de gestión. Fue Director del Instituto de Biotecnología en dos periodos (1997 y 2005), Presidente de la Academia de Ciencias de Morelos (2004-2006) y Director del Sistema Nacional de Investigadores (2008-2009). También se desempeñó como Director General del Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN) de la Secretaría de Salud entre 2009 y 2019. Su gestión le valió el reconocimiento “Doctor Guillermo Soberón Acevedo” al Mérito al Desarrollo de Instituciones en 2022.

En noviembre de 2022, el rector Enrique Graue lo nombró Coordinador del Centro de Ciencias de la Complejidad (C3) de la UNAM, adscrito a la Coordinación de la Investigación Científica. En esta función, continúa con su firme compromiso de impulsar la investigación interdisciplinaria y fomentar la colaboración científica.